初三女生与40岁已婚男人自愿发生性关系，法律上

初三女生与40岁已婚男自愿发生性关系，若女生不满14岁则男方构成犯罪。依据《中华人民共和国刑法》相关规定，与不满14周岁的女性发生性关系，无论对方是否自愿，均视为强奸。若未及时处理，可能导致男方受到刑事追究，严重影响双方生活。
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应依法处理。若女生未满14岁，立即报警，男方将承担刑事责任；若女生已满14岁，双方可协商处理后续事宜，如精神赔偿等；若协商不成，女生及其家属可通过法律途径维权，提起诉讼，要求男方承担相应责任；同时，若男方已婚，其行为还可能涉及婚姻法的相关规定，需考虑其对婚姻关系的破坏及可能承担的法律后果。
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此情况需根据女生年龄及双方关系判断处理方式，若女生未成年，则应立即报警；若已成年，可协商或诉讼解决。选择处理方式时，应优先考虑女生权益保护，若涉及未成年人，必须依法处理，不得私了。对于成年人间的纠纷，可优先考虑协商，协商不成再诉诸法律。